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Bioinformatik für Biowissenschaften I
| Veranstaltungstyp | Vorlesung und Übung |
|---|---|
| Dozent | Prof. D. Frishman (Vorlesung), Florian Goebels, Harald Marx (Übungen) |
| Zeit | Mittwoch, 09:55–11:25 |
| Turnus | wöchentlich vom 19.10.2011 bis zum 08.02.2012 |
| Raum | Hörsaal HS14 (V), HS16/HS10 (Ü) |
| Unterrichtssprache | Deutsch |
| Punkte | 4 |
Aktuelles
- Die Klausureinsicht für die zweite Klausur findet NUR am 18.5.2012 von 11:00 bis 12:00 im Raum OGL-25 statt
- Die Klausureinsicht für die erste Klausur findet am 29.3.2012 um 15:00 im Raum OGL-25 statt
- Die Nachholklausur findet am 21.04 um 10:00 im HS 14 statt
- Übung fällt am 21.12 und am 23.12 aus
- Klausur am Samstag, den 18.02.2012, 10:00-12:00 Uhr
- Anmeldung über TUM-Online bis zum 6. Januar wer sich nicht anmeldet ist nicht zugelassen
Vorlesungs- und Übungstermine
Vorlesung:
Übung:
- 14.12.11 und 16.12.11 - Uebungsblatt 8
- 11.01.12 und 13.01.12 - Uebungsblatt 9
Inhalt
Einführung in grundlegende Konzepte und Methoden in der Bioinformatik. Themenschwerpunkte sind u.a.:
- Übersicht über Aufgaben und Ziele der Bioinformatik
- Einführung in die molekularen Grundlagen der Biologie mit Bezug zur Bioinformatik
- Aufgaben der Sequenz- und Genomanalyse
- Grundlagen zu Datenstrukturen
- Einführung in String-Algorithmen zum Sequenzvergleich
- Sequenz-Alignment: Needleman-Wunsch, Smith-Waterman
- Sequenzsuchen in Datenbanken: FASTA, BLAST
- Sekundäre Analyse von Sequenzinformationen: Pattern, gewichtete Matrizen, HMM
- Genvorhersagen in Prokaryonten
Literatur
- M. Zvelebil & J. Baum, Understanding Bioinformatics, Garland Science
