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Bioinformatik für Biowissenschaften I

Veranstaltungstyp Vorlesung und Übung
Dozenten Prof. Dmitrij Frishman (Vorlesung), Marina Parr (Übung)
Zeit Mittwoch, 10:00–11:30
Turnus wöchentlich vom 04.11.2020 bis zum 10.02.2021
Raum Zoom
Punkte 4 ECTS

News

  • Die Vorlesung und Übung wird über zoom stattfinden. Mehr dazu im Moodle Kurs.
  • Die Vorlesung findet von 10:00 Uhr bis 11:30 statt. Die Übung findet immer vor der Vorlesung von 08:30 - 10:00 statt.
  • In der ersten Woche (4.11.20) findet nur die Vorlesung, jedoch noch keine Übung statt.
  • Bitte melden Sie sich in TUMonline auch zur Übung zur Vorlesung an. Sie werden dann automatisch im moodle Kurs angemeldet. Die Übungsblätter und Vorlesungsfolien werden zukünftig im moodle Kurs (Bioinformatik für Biowissenschaften I) bereitgestellt.
  • Ab dem kommenden Wintersemester werden die Übungen in Englisch gehalten.

 

Inhalt

Einführung in grundlegende Konzepte und Methoden in der Bioinformatik. Themenschwerpunkte sind u.a.:

  • Übersicht über Aufgaben und Ziele der Bioinformatik
  • Einführung in die molekularen Grundlagen der Biologie mit Bezug zur Bioinformatik
  • Aufgaben der Sequenz- und Genomanalyse
  • Grundlagen zu Datenstrukturen
  • Einführung in String-Algorithmen zum Sequenzvergleich
  • Sequenz-Alignment: Needleman-Wunsch, Smith-Waterman
  • Sequenzsuchen in Datenbanken: FASTA, BLAST
  • Sekundäre Analyse von Sequenzinformationen: Pattern, gewichtete Matrizen, HMM
  • Genvorhersagen in Prokaryoten

 

Literatur 

  • M. Zvelebil & J. Baum, Understanding Bioinformatics, Garland Science

Zielgruppe

Grundvorlesung für das 3. Fachsemester der Studiengänge Biologie, Biochemie und Molekulare Biotechnologie.