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Bioinformatik für Biowissenschaften I

Veranstaltungstyp Vorlesung und Übung
Dozenten Prof. Dmitrij Frishman (Vorlesung), Michael Kiening (Übung)
Zeit Mittwoch, 10:00–11:30
Turnus wöchentlich vom 16.10.2019 bis zum 05.02.2020
Raum Hörsaal HS14 (V), HS14 (Ü)
Punkte 4 ECTS

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  • Die Vorlesung findet in HS14 von 10:00 Uhr bis 11:30 statt. Die Übung findet immer vor der Vorlesung von 08:30 - 10:00 im HS14 statt.
  • In der ersten Woche (16.10.19) findet nur die Vorlesung, jedoch noch keine Übung statt.
  • Bitte melden Sie sich in TUMonline auch zur Übung zur Vorlesung an. Sie werden dann automatisch im moodle Kurs angemeldet. Die Übungsblätter und Vorlesungsfolien werden zukünftig im moodle Kurs (Bioinformatik für Biowissenschaften I) bereitgestellt.
  • Aufgrund der Fachschaftsvollversammlung findet am 30.10.2019 keine Vorlesung und keine Übung statt.

 

Inhalt

Einführung in grundlegende Konzepte und Methoden in der Bioinformatik. Themenschwerpunkte sind u.a.:

  • Übersicht über Aufgaben und Ziele der Bioinformatik
  • Einführung in die molekularen Grundlagen der Biologie mit Bezug zur Bioinformatik
  • Aufgaben der Sequenz- und Genomanalyse
  • Grundlagen zu Datenstrukturen
  • Einführung in String-Algorithmen zum Sequenzvergleich
  • Sequenz-Alignment: Needleman-Wunsch, Smith-Waterman
  • Sequenzsuchen in Datenbanken: FASTA, BLAST
  • Sekundäre Analyse von Sequenzinformationen: Pattern, gewichtete Matrizen, HMM
  • Genvorhersagen in Prokaryoten

 

Literatur 

  • M. Zvelebil & J. Baum, Understanding Bioinformatics, Garland Science

Zielgruppe

Grundvorlesung für das 3. Fachsemester der Studiengänge Biologie, Biochemie und Molekulare Biotechnologie.