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Bioinformatik für Biowissenschaften I

Materialien
Veranstaltungstyp Vorlesung und Übung
Dozenten Prof. Dmitrij Frishman (Vorlesung), Peter Hönigschmid (Übung), Michael Kiening (Übung), Martina Weigl (Übung)
Zeit Mittwoch, 10:00–11:30
Turnus wöchentlich vom 18.10.2017 bis zum 07.02.2018
Raum Hörsaal HS14 (V), HS16 (Ü)
Punkte 4 ECTS

News
  • ACHTUNG: Vorlesungszeit und -raum haben sich kurzfristig geändert. Die Vorlesung findet nun in HS14 von 10:00 Uhr bis 11:30 statt.
  • In der ersten Woche (18.10.17) findet nur die Vorlesung, jedoch noch keine Übung statt.

 

Inhalt

Einführung in grundlegende Konzepte und Methoden in der Bioinformatik. Themenschwerpunkte sind u.a.:

  • Übersicht über Aufgaben und Ziele der Bioinformatik
  • Einführung in die molekularen Grundlagen der Biologie mit Bezug zur Bioinformatik
  • Aufgaben der Sequenz- und Genomanalyse
  • Grundlagen zu Datenstrukturen
  • Einführung in String-Algorithmen zum Sequenzvergleich
  • Sequenz-Alignment: Needleman-Wunsch, Smith-Waterman
  • Sequenzsuchen in Datenbanken: FASTA, BLAST
  • Sekundäre Analyse von Sequenzinformationen: Pattern, gewichtete Matrizen, HMM
  • Genvorhersagen in Prokaryoten

 

Literatur 

  • M. Zvelebil & J. Baum, Understanding Bioinformatics, Garland Science

Zielgruppe

Grundvorlesung für das 3. Fachsemester der Studiengänge Biologie, Biochemie und Molekulare Biotechnologie.