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Bioinformatik für Biowissenschaften I

Veranstaltungstyp Vorlesung und Übung
Dozenten Prof. Dmitrij Frishman (Vorlesung), Peter Hönigschmid (Übung), Michael Kiening (Übung)
Zeit Mittwoch, 09:45–11:15
Turnus wöchentlich vom 19.10.2016 bis zum 08.02.2017
Raum Hörsaal HS14 (V), Mittwoch HS16, Freitag HS6 (Ü)
Punkte 4 ECTS

Vorlesung

  • Die Vorlesung findet Mittwochs ab 9:45 in HS 14 statt.
  • In der ersten Woche (19.10.16 & 21.10.16) findet noch keine Übung statt!

News

  • Die Übung findet immer Mittwochs von 08:30 - 09:30 im Raum HS 16 statt. Es gibt keinen weiteren Übungstermin.
  • Die Übung am 25.01.2017 entfällt.
  • Am 01.02.2017 findet eine Klausurfragestunde in der Übung statt. Sendet uns per email eure Fragen vorab zu, damit wir dazu einige Folien vorbereiten können.
  • Die Klausur findet am Samstag, den 25.02.2017 von 10:00 - 12:00 Uhr im Raum HS 14 statt.
  • Am Mittwoch den 08.02.2016 findet keine Vorlesung und keine Übung statt.
  • Die Klausureinsicht ist offiziell am 18.04.2017 von 10:00 - 12:00 sowie von 14:00 - 16:00 Uhr möglich. Die Einsicht findet in unserem Seminarraum (OG-L19 Maximus-von-Imhof Forum 3) statt. Seperate Termine können mit den Übungsleitern vereinbart werden.
  • Die Nachklausur findet am 28.04.2017 von 14-16 Uhr im Raum HS 15 statt. bitte melden Sie sich zur Klausur in TUMonline an.

 

Inhalt

Einführung in grundlegende Konzepte und Methoden in der Bioinformatik. Themenschwerpunkte sind u.a.:

  • Übersicht über Aufgaben und Ziele der Bioinformatik
  • Einführung in die molekularen Grundlagen der Biologie mit Bezug zur Bioinformatik
  • Aufgaben der Sequenz- und Genomanalyse
  • Grundlagen zu Datenstrukturen
  • Einführung in String-Algorithmen zum Sequenzvergleich
  • Sequenz-Alignment: Needleman-Wunsch, Smith-Waterman
  • Sequenzsuchen in Datenbanken: FASTA, BLAST
  • Sekundäre Analyse von Sequenzinformationen: Pattern, gewichtete Matrizen, HMM
  • Genvorhersagen in Prokaryoten

 

Literatur 

  • M. Zvelebil & J. Baum, Understanding Bioinformatics, Garland Science

Zielgruppe

Grundvorlesung für das 3. Fachsemester der Studiengänge Biologie, Biochemie und Molekulare Biotechnologie.